Penyakit diare masih merupakan masalah kesehatan masyarakat di negara berkembang seperti di Indonesia, karena morbiditas dan mortalitas yang masih tinggi. Penyakit diare dapat menyebabkan kematian apabila tidak diatasi dengan segera. Sistem pakar sebenarnya bukan untuk menggantikan peran manusia, tetapi untuk mensubstitusikan pengetahuan manusia ke dalam bentuk sistem, sehingga dapat digunakan oleh orang banyak. Salah satu sistem pakar yang dapat digunakan yaitu sistem pakar diagnosis penyakit diare. Adapun metode inferensi yang digunakan adalah Forward Chaining dengan teknik penelusuran Depth First Search dan metode Certainty Factor yang digunakan sebagai nilai kepercayaan penyakit. Sistem ini dibangun berbasis web dengan bahasa pemograman PHP dan menggunakan database MySQL untuk menyimpan data yang digunakan. Hasil perhitungan Certainty Factor yang diimplementasikan pada sistem sudah sesuai dengan perhitungan dan cara kerja Certainty Factor yang sebenarnya. Hasil pengujian keakuratan sistem dengan pakar didapatkan nilai keakurasian sistem sebesar 100%, dan didapatkan hasil bahwa 89.5% pasien diare sangat setuju bahwa sistem mudah digunakan dalam melakukan diagnosis. Kata Kunci : Sistem Pakar, Penyakit Diare, Forward Chaining, Depth First Search, Certainty Factor.