Paru-paru merupakan bagian dari pernapasan manusia yang befungsi menjadi wadah pertukaran oksigen melalui permukaan udara menjadi karbon dioksida didalam darah. Homotopy Tree adalah metode yang digunakan untuk mendapatkan suatu batas objek pada citra dengan melihat persamaan warna terhadap ketetanggaanya. Uji coba dengan proses manual menggunakan metode ROI Free Hand. Pada pengujian ini menggunakan 93 sampel citra x-ray thorax yang dihitung hasil validasi dari bagian organ paru paru bagian kanan dan kiri. Sistem aplikasi ini menghitung hasil akurasi, sensitifitas ,spesifitas, dice, hausdorff, Jaccard, MSSD dan PNSR paru-paru manusia secara otomatis yang dapat mempermudah pekerjaan medis seperti membantu radiologi. Pada perhitungan validasi nilai rata – rata yang dihasilkan menggunakan 93 sampel percobaan citra x-ray thorax paru – paru dengan metode Homotopy Tree. Untuk paru –paru kanan menghasilkan nilai rata – rata akurasi 89,33 %, sensitifitas 68,57 %, spesifitas 93,58 %, dice 0,81%, hausdorff 30,07%, jaccard 0,68%, MSSD 140,08% dan PNSR 12,82%. Sedangkan paru – paru kiri menghasilkan nilai rata – rata akurasi 90,65%, sensitifitas 65,94 %, spesifitas 94,91 %, dice 0,79%, hausdorff 52, 34%, jaccard 0,65%, MSSD 2461,54% dan PSNR 13,08%.

Kata kunci: Paru-paru, Homotopy Tree, citra x-ray thorax.